let samtools =
  let url = "https://github.com/samtools/samtools/releases/download/1.3/samtools-1.3.tar.bz2" in
  let toplevel_tools = ["samtools"] in
  let htslib = ["bgzip"; "tabix" ] in
  let tools = toplevel_tools @ htslib in
  let install_program ~path =
    let open KEDSL.Program in
    sh "make"
    && shf "cp %s %s" (String.concat toplevel_tools ~sep:" ")  path
    && sh "cd htslib*/"
    && sh "make"
    && shf "cp %s %s" (String.concat htslib ~sep:" ") path
    && sh "echo Done"
  in
  let witness = witness_list tools in
  installable_tool Machine.Tool.Default.samtools ~url ~install_program
    ~init_program:add_to_dollar_path ~witness