sig
  module Remove = Biokepi_run_environment.Workflow_utilities.Remove
  val default_prior_probability : float
  val default_theta : float
  module Configuration :
    sig
      type t = { name : string; prior_probability : float; theta : float; }
      val to_json :
        Biokepi_bfx_tools.Somaticsniper.Configuration.t -> Yojson.Basic.json
      val name : Biokepi_bfx_tools.Somaticsniper.Configuration.t -> string
      val render :
        Biokepi_bfx_tools.Somaticsniper.Configuration.t -> string list
      val default : Biokepi_bfx_tools.Somaticsniper.Configuration.t
    end
  val run :
    run_with:Biokepi_run_environment.Machine.t ->
    ?configuration:Biokepi_bfx_tools.Somaticsniper.Configuration.t ->
    normal:Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.bam_file
           Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.workflow_node ->
    tumor:Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.bam_file
          Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.workflow_node ->
    result_prefix:string ->
    unit ->
    < exists : Ketrew_pure.Target.Condition.t;
      is_bigger_than : int -> Ketrew_pure.Target.Condition.t;
      is_done : Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.Condition.t option;
      path : string >
    Biokepi_run_environment.Common.KEDSL.workflow_node
end