Module Biokepi.Tools (.ml)

module Tools: Biokepi_bfx_tools

Implementations of the Bioinformatics Ketrew workflow-nodes.

This module provides a lower-level access to the bioinformatics tools to build Ketrew workflows.

It is used by the EDSL (through Biokepi.EDSL.Compile.To_workflow) but users are welcome to use it directly if needed.

module Bedtools: sig .. end

module Bwa: sig .. end

module Cufflinks: sig .. end

module Cycledash: sig .. end

module Gatk: sig .. end

module Hisat: sig .. end

module Kallisto: sig .. end

module Mosaik: sig .. end

module Muse: sig .. end

module Mutect: sig .. end

module Optitype: sig .. end

module Picard: sig .. end

module Samtools: sig .. end

module Seq2HLA: sig .. end

module Somaticsniper: sig .. end

module Star: sig .. end

module Strelka: sig .. end

module Stringtie: sig .. end

module Varscan: sig .. end

module Vcftools: sig .. end

module Virmid: sig .. end